Обложка канала

Аня в Италии 🇮🇹. Страница 7

Учусь в аспирантуре в Gran Sasso Science Institute, Л'Аквила, Италия. Пишу о еде, культуре, быте и бюрократии в Италии и о буднях PhD студента-математика.

  • Аня в Италии 🇮🇹

    Возвращаюсь в ваши ленты с новостью из своей научной жизни) Вспомнила, что не поделилась с вами своей самой первой в жизни научной статьёй! Хотя она вышла уже полгода назад 🙈 Но блог всё-таки не только про Италию, но и про Аню, так что фиксирую это важное событие и оставляю ссылку на статью про наш метод jewel 💎 Вкратце о сути своей работы я рассказывала вот в этом посте. Если ещё более вкратце – по измерениям нескольких переменных из нескольких источников ищем связи между этими переменными. Вообще это можно применять хоть где, но нам нравится биология, поэтому в статье пример поиска связей между генами на основании измерений их экспрессии (активности) на разном оборудовании. Один из проектов, над которым я работаю сейчас – апгрейд этого метода) Так что надеюсь, что не за горами и статья про jewel 2.0 😉
    Jewel: A Novel Method for Joint Estimation of Gaussian Graphical Models

    In this paper, we consider the problem of estimating multiple Gaussian Graphical Models from high-dimensional datasets. We assume that these datasets are sampled from different distributions with the same conditional independence structure, but not the same precision matrix. We propose jewel, a joint data estimation method that uses a node-wise penalized regression approach. In particular, jewel uses a group Lasso penalty to simultaneously guarantee the resulting adjacency matrix’s symmetry and the graphs’ joint learning. We solve the minimization problem using the group descend algorithm and propose two procedures for estimating the regularization parameter. Furthermore, we establish the estimator’s consistency property. Finally, we illustrate our estimator’s performance through simulated and real data examples on gene regulatory networks.

    MDPI
  • Аня в Италии 🇮🇹

    Вчера итальянцы встретили за семейным ужином Vigilia di Natale — канун Рождества — и сходили на полуночную Messa della Notte, а сегодня снова соберутся (уже на семейный обед) и будут друг друга поздравлять с Рождеством. Мы же в честь этого посмотрим уже традиционное видео с рождественским #итальянскийсупермаркет 🎄 Buon Natale!
  • Аня в Италии 🇮🇹

    Ура 🥳🥳🥳 Победитель в розыгрыше календаря определён ⬆️ Большое спасибо всем за участие ❤️
  • Реклама

  • Аня в Италии 🇮🇹

    Разыгрываем календарь Italy! 🇮🇹
  • Аня в Италии 🇮🇹

    ​​✨РОЗЫГРЫШ✨ Традиционно каждый год я дарю своим дорогим подписчикам красивые календари: с итальянскими городами 😍 и итальянскими блюдами 😋 В этом году решила сделать розыгрыш на месяц раньше обычного, чтобы победителю не приходилось начинать календарь с февраля) Итак! Если вы хотите любоваться на Рим, Милан, Геную, Катанию и другие итальянские города – подписывайтесь на канал и нажимайте кнопку "Участвую!" в посте ниже. Обратите внимание, что календарь небольшого формата 18x18, так что даже для тех, у кого не очень много места на стене) Если же вам больше по душе лазанья, ризотто, джелато и вино (и хочется календарь побольше 30x30) – отправляйтесь в мой инстаграм. Участвовать можно в обоих розыгрышах 😉 Итоги подведём 8 декабря – в день, когда итальянцы официально начинают готовиться к Рождеству 🎄 Удачи!
  • Аня в Италии 🇮🇹

    🏥 Медицина в Италии – инструкция Где оказывают неотложную помощь? Как записаться к узкому специалисту? Где ночью найти открытую аптеку? Что такое guardia medica или CUP? Ответы на эти вопросы собрала в новой статье. Не претендую на полный охват всей системы здравоохранения, но думаю, что эти советы будут очень-очень полезны тем, кто переехал в Италию. Спасибо моим подписчикам, а также @real_italy, @worsethanBD, @unarussainitalia и @gentlereminder за помощь в написании. Читать вконтакте, в жж и в жж на английском.
    Медицина в Италии – советы

    В этой статье я собрала советы, касающиеся медицины в Италии: куда обращаться за неотложной помощью, как записаться к узкому специалисту,..

    VK
  • Аня в Италии 🇮🇹

    Пост-знакомство, он же навигация 🙂 Меня зовут Аня и четыре года назад я переехала в Италию в город Л'Аквила. За это время я получила здесь степень PhD (~кандидат наук) по математике, и сейчас работаю постдоком в Институте прикладного анализа. А мой муж Влад занимается фотографией, так что обращайтесь 😉 Главная цель моего канала – помочь моим читателям с бюрократией. Но она, к счастью, случается не каждый день, так что в остальное время я делюсь своими открытиями и рассказываю о том, что меня удивляет в Италии – в культуре, быте и, конечно, еде 🍝 📑 Все посты про бюрократию 🏟 Путешествия по Италии (с полезными советами) 🏥 Медицина в Италии – инструкция 🎧 Подкасты «Вопрос-ответ» про жизнь в Италии и «Алло?» про жизнь в других странах 🇮🇹 Серия постов «8 способов поделить Италию» 🛒 Репортажи про еду #итальянскийсупермаркет #итальянскаястоловая 😎 Забавное из процесса изучения языка #учимитальянский 🏔 Л’Аквила – город, где я живу #АнявЛаквиле 🧡 Добрый пост: год после переезда 🧡 Добрый пост: PhD acknowledgements Меня можно читать также в Инстаграме, в Яндекс.Дзене и даже в ЖЖ.
  • Аня в Италии 🇮🇹

    Навигация: ссылки на все посты о бюрократии. Очень надеюсь, что вам это будет полезно! Permesso di soggiorno • По мотиву учёбы для PhDПо мотиву воссоединения семьи Для PhD и постдоков • Tessera sanitaria для PhD-студентов, постдоков и членов семьиПособие по безработице DIS-COLL для PhD и постдоков Как получить... • SPID (аля Госуслуги) и ISEEResidenza в Италии Санитарный сертификат на квартиру (attestazione di idoneità alloggiativa) До переезда • Студенческая виза типа DТурвиза по приглашению от не-гражданина ЕС с пермессоПодтверждение степени (dichiarazione di valore) в консульствеЗаверение свидетельства о браке в консульстве
  • Аня в Италии 🇮🇹

    Четыре года в Италии 🇮🇹✌️Раньше это был важный день обратного отсчёта: на один год больше после переезда = на один год меньше осталось времени на кандидатскую, надо торопиться. Но цель наконец-то достигнута, можно выдохнуть (и порадоваться, что вся эта авантюра была не зря). Но Италия меня не отпускает: я нашла тут работу! Вот уже 3,5 месяца я постдок (~младший научный сотрудник) в Национальном исследовательском совете (Consiglio Nazionale delle Ricerche, CNR). Это большая организация, которая объединяет в себе 106 научных институтов и 7000 сотрудников по всей Италии. Я работаю в неаполитанском филиале Института прикладного анализа со своей научной руководительницей с PhD. Но живу пока всё так же в Л’Аквиле — ура смартворки) 😊 У меня три проекта и контракт на год, чтобы успеть их сделать 🙈 Бывает сложно, но пока очень интересно) Вот такие новости) Рассказать что-нибудь про работу в науке в Италии?
  • Аня в Италии 🇮🇹

    Заводная амальфитанская свадьба для бодрого начала недели!
  • Аня в Италии 🇮🇹

    ​​С Днём всех влюблённых! ❤️ Когда в следующий раз кто-то из ваших знакомых начнёт разглагольствовать "ой, день святого Валентина – католический праздник, мы-то чего его празднуем", расскажите ему, что католики-итальянцы вкладывают в праздник не больше сакрального значения, чем представители любой другой религии) Потому что он просто про любовь 🥰 И про конфеты! Особенно про Baci, т.е. "поцелуи», потому что в фантике каждой конфеты записочка с цитатой про любовь) А вот валентинки, кстати, итальянцы не дарят.

    Если вы хотите сегодня признаться в любви на итальянском, почитайте, как правильно это сделать. А если вам всё-таки не даёт покоя святой Валентин, почитайте про город, где он похоронен. Бачи! 😘
  • Аня в Италии 🇮🇹

    Я нашла самую итальянскую адаптацию привычных нам концепций) Пока вы в торговых автоматах покупаете растворимый кофе и чипсы, итальянцы пошли гораздо дальше – они сделали вэндинг-машину с вином!! 😂 Выбор на любой вкус, от тетрапака за три евро до просекко за шестнадцать, а также есть граппа, лимончелло, пиво. Не забыли и про пластиковые стаканчики и печеньки на закуску, вот какой сервис 😂

    Интересно, кстати, как автомат работает: есть специальный слот, куда вставляется карточка с айди – это может быть ИНН или ОМС, номер там один и тот же – и таким образом контролируется, что покупатель совершеннолетний 👌 Похожим образом работают автоматы с сигаретами и лотерейными билетами. В Л'Аквиле есть даже автомат-сексшоп 😃

    В общем, когда дело касается удовольствий и особенно вина, итальянцы проявляют удивительную изобретательность) Всё ради дольче виты 24/7 😎🍷
  • Аня в Италии 🇮🇹

    Вот такие дела) Пишите, если у вас есть какие-то вопросы про это или вообще про PhD 👍
  • Аня в Италии 🇮🇹

    ​​Логичный вопрос: зачем что-то придумывать? Так не видно, что ли? Не видно. При измерении экспрессии генов у вас получается табличка размером не 7 на 4, как в нашем примере с погодой, а где-то 50 на 20 000. Да-да, такие числа: техника позволяет измерить экспрессию десятков тысяч генов! Связь между ними уже на глаз не определишь 😬 А самих измерений очень мало, потому что эксперименты дорогие: редким проектам удаётся измерить экспрессию больше, чем у нескольких десятков человек. Классические математические методы не были готовы к таким выкрутасам – ни к объёму в тысячи переменных, ни к тому, что будет такая огромная диспропорция в размерах таблицы. Приходится придумывать что-то новое и писать про это кандидатскую диссертацию)) Ну, а когда метод уже готов, беру из открытой базы Gene Expression Omnibus реальные данные экспрессии генов, применяю метод к ним и смотрю, что получится)) Вот пример данных оттуда – по горизонтали названия генов (всего >16 тыс), по вертикали кодовые номера пациентов (77 человек), в ячейках экспрессия гена.
  • Аня в Италии 🇮🇹

    ​​А что, если теперь у нас таких табличек несколько? Допустим, цены на акции на разных биржах. Или экспрессию генов у больных одним и тем же заболеванием измерили на разном оборудовании? Или те же погодные переменные померили в разных местах? Температура и влажность воздуха будут разными в Новосибирске и Риме, но мы предполагаем, что связь между ними довольно похожа, что они и там, и там одинаково влияют друг на друга (или находятся под влиянием какого-то третьего фактора). Давайте придумаем метод, который по значениям чисел в этих двух, трёх, пяти табличках тоже построит граф связей между переменными. Этим я и занимаюсь 👍
  • Реклама

  • Аня в Италии 🇮🇹

    ​​Математики смотрят и думают – вот бы по этим числам понять, какая переменные связаны, как они друг на друга влияют! И нарисовать это – пусть точечки будут переменными, а чёрточки обозначают, что между ними есть связь! И придумывают специальный метод, который может по значениям чисел в табличке построить такой граф.
  • Аня в Италии 🇮🇹

    ​​Где-то месяц назад я отправила свою кандидатскую работу двум рецензентам и теперь жду их отзывов, над которыми они могут размышлять до двух месяцев. Они могут порекомендовать или какие-то правки, или масштабную переработку исследования. Пока я жду их решения (надеясь, конечно, что они напишут "О Дио, ваша работа совершенна, не меняйте ничего" 😂), я занимаюсь применением своего метода к реальным данным. И вот решила с вами поделиться, что это за зверь такой, "реальные данные" 😃

    Давайте что-нибудь измерять. Например, можем измерять погодные переменные – температуру, давление, скорость ветра. Или сколько стоят акции Гугла, Яндекса и Теслы на бирже. Или можно померить экспрессию гена А, гена Б и гена С (про то, что такое экспрессия я рассказывала тут – скажите, если непонятно, я напишу ещё раз 👍)

    Вот, померили мы сегодня наши переменные – получился у нас какой-то набор чисел, допустим, (-10 градусов, 753 мм рт.ст., 74%, 0 м/с). А что, если мы теперь это будем измерять каждый день? Тогда у нас таких наборов будет уже много и получится такая табличка:
  • Аня в Италии 🇮🇹

    Около года назад я делала обзор на безглютеновые продукты в итальянском супермаркете, посмотреть его можно тут. Сейчас руки дошли до продуктов без лактозы: растительное молоко, сыры, мороженое, всякие сладости. Любопытно, что у многих молочных продуктов есть безлактозная альтернатива того же бренда, которая продаётся в обычном супермаркете (хоть и довольно большом), не нужно искать в специальных магазинах. Цены где-то в 1.5 раза выше, чем на обычные продукты.

    Ставьте 👍, если стоит дальше показывать итальянские супермаркеты, и пишите в комментариях, что ещё вам было бы интересно увидеть)