Обложка канала

Аня в Италии 🇮🇹

Учусь в аспирантуре в Gran Sasso Science Institute, Л'Аквила, Италия. Пишу о еде, культуре, быте и бюрократии в Италии и о буднях PhD студента-математика.

Аня в Италии 🇮🇹

5 лет назад
Открыть в
Возвращаюсь в ваши ленты с новостью из своей научной жизни) Вспомнила, что не поделилась с вами своей самой первой в жизни научной статьёй! Хотя она вышла уже полгода назад 🙈 Но блог всё-таки не только про Италию, но и про Аню, так что фиксирую это важное событие и оставляю ссылку на статью про наш метод jewel 💎 Вкратце о сути своей работы я рассказывала вот в этом посте. Если ещё более вкратце – по измерениям нескольких переменных из нескольких источников ищем связи между этими переменными. Вообще это можно применять хоть где, но нам нравится биология, поэтому в статье пример поиска связей между генами на основании измерений их экспрессии (активности) на разном оборудовании. Один из проектов, над которым я работаю сейчас – апгрейд этого метода) Так что надеюсь, что не за горами и статья про jewel 2.0 😉
Jewel: A Novel Method for Joint Estimation of Gaussian Graphical Models

In this paper, we consider the problem of estimating multiple Gaussian Graphical Models from high-dimensional datasets. We assume that these datasets are sampled from different distributions with the same conditional independence structure, but not the same precision matrix. We propose jewel, a joint data estimation method that uses a node-wise penalized regression approach. In particular, jewel uses a group Lasso penalty to simultaneously guarantee the resulting adjacency matrix’s symmetry and the graphs’ joint learning. We solve the minimization problem using the group descend algorithm and propose two procedures for estimating the regularization parameter. Furthermore, we establish the estimator’s consistency property. Finally, we illustrate our estimator’s performance through simulated and real data examples on gene regulatory networks.

MDPI