Вместо Superagent (который использует Supertest), supertest-fetch основан на node-fetch. node-fetch имеет меньше зависимостей и более привычен по своему API.
Из других важных фич - полная поддержка TypeScript. В Supertest часто возникают странности с типами. Также supertest-fetch поддерживает промисы.