Благодаря строению пищеварительной системы многие обитатели морских глубин естественным образом фильтруют воду, в которой находятся.
Существует направление развития марикультуры - санитарная марикультура, которое занимается культивированием гидробионтов с целью биологической очистки прибрежных вод.
За одни сутки 1м2 мидиевой банки (скопление мидий) фильтрует до 90м3 воды, и способно снизить количество патогенных бактерий в воде в 2 раза за один "прогон" жидкости.