Поисковая система Яндекса теперь лучше воспринимает протокол HTTP/2, чем раньше. На частоту обхода страниц и изменение позиций сайта в результатах поиска Яндекса HTTP/2 напрямую не влияет. Однако протокол позволяет увеличить скорость загрузки страниц, снизить ожидания ответа сервера для пользователей и сэкономить трафик. Если же вы используете HTTP/1.1, робот продолжит индексировать ваш сайт. Эти два протокола совместимы, поэтому конфликтов с настройками вашего сервера не будет.