На 3-4 октября 1993 года пришелся пик острейшего политического кризиса в России, вызванного противостоянием правительства Бориса Ельцина и Верховного Совета, что в конечном итоге привело к смене модели власти. Основные события разворачивались на улицах Москвы: в столкновениях регулярных войск и сторонников Парламента, по официальным данным, погибло 158 человек, 423 были ранены. В этом конфликте принимал участие и российский спецназ.
Накануне активной фазы противостояния начальник службы безопасности Президента РФ Александр Коржаков вызвал своего заместителя, капитана первого ранга Геннадия Захарова и объявил, что Ельцин принял решение «зачистить» здание Верховного Совета. Захаров, который был инициатором обстрела Парламента, в ответ предложил привлечь к этой операции спецподразделения «Альфа» и «Вымпел».
Днем 4 октября спецназовцев на бронетехнике доставили к подъездам Белого дома. Однако командиры группы «Альфа» в последний момент отказались идти на штурм здания, решив убедить забаррикадировавшееся там руководство Верховного Совета в необходимости мирной сдачи своих позиций. Переговоры длились два часа, и в конце концов оппозиционеры согласились с условиями «альфовцев». После 17:00 спецназовцы приступили к эвакуации людей из горящего здания. К сожалению, в, казалось бы, мирной операции, не обошлось без жертв. Спасая раненых у стен Белого дома, погиб офицер «Альфы» Геннадий Сергеев.
Согласно версии Марата Мусина, специалиста по финансовой разведке, который был среди защитников Парламента, в Сергеева стрелял снайпер, расположившийся в здании, контролируемом сторонниками Ельцина. По данным журналиста Марка Дейча, выстрел был произведен из помещения фабрики имени Капранова, которое в советское время КГБ использовал для наблюдения за американским посольством. Сергееву посмертно было присвоено звание Героя России.