Изначально сиквел «Человека-паука: Через вселенные» напоминал «Мстителей: Финал» Согласно ведущему аниматору, мультфильм представлял собой 2,5-часовой блокбастер, однако команда решила разбить историю на две части, чтобы расширить некоторые сюжетные арки