Если где-то убыло, значит, где-то прибыло. Как оказалось, это справедливо для младенцев, рожденных с помощью кесарева сечения, которым достается меньше вагинальных и фекальных материнских бактерий. Ученые изучили бактериальные сообщества младенцев, рожденных естественным способом и с помощью кесарева сечения, чтобы сравнить их состав с материнской микробиотой. В исследовании поучаствовали 120 женщин из Голландии и их новорожденные дети. У младенцев авторы собрали образцы микробиоты кожи, носоглотки, слюны и кишечника спустя два часа после рождения, через сутки, неделю, две недели и через месяц. У матерей взяли образцы бактерий влагалища, кожи, носа и зева, кишечника и грудного молока.  Исследователи секвенировали 16S-рибосомную РНК всех образцов. Разнообразие кишечной микробиоты в течение первого месяца жизни детей увеличивалось. Для детской микробиоты носоглотки, слюны и кожи был характерен немного другой сценарий: сначала ее разнообразие было высоким, затем следовал быстрый отбор (в течение первых нескольких дней жизни), а затем разнообразие снова росло. Однако состав материнских бактерий из всех ниш все равно был богаче в любой момент времени — это значит, что с микробное разнообразие продолжает увеличиваться с возрастом. Со временем микробиота разных участков организма становилась все более дифференцированной, а сходство материнской и детской микробиоты уменьшалось. Когда детям исполнился месяц, наиболее схожими с материнскими оставались кожные микробные сообщества, а наименее — сообщества носоглотки. В среднем около 58,5 процентов микробиоты дети унаследовали от матери — причем независимо от способа рождения. Но то, какой вклад различные материнские микробные сообщества внесли в микробиоту детей, зависело от способов родов и вскармливания.  В день родов ученые наблюдали значительно больший вклад вагинальной микробиоты в микробиоту носоглотки у младенцев, рожденных естественным путем, по сравнению с младенцами, родившимися с помощью кесарева сечения. Например, рожденным с помощью кесарева недоставало лактобактерий. У детей, родившихся с помощью кесарева сечения, было меньше фекальных бактерий от матери, но зато больше бактерий из грудного молока. Ученые предположили, что это такой компенсаторный механизм: недостаток посева фекальной микробиоты во время кесарева сечения возмещается большим посевом бактерий из грудного молока. Кожная микробиота детей на грудном вскармливании содержала больше материнских бактерий кожи, чем из других ниш. У детей, которых не кормили грудью, исследователи обнаружили более высокий вклад микробиоты носоглотки матери в микробиоту кожи и слюны. Возможно, это тоже компенсация.