Схожие черты лица могут быть просто совпадением или проявлением родства — а могут быть симптомом каких-то нарушений в организме. Группа ученых столкнулась с тремя случаями задержки развития нервно-психического развития у детей в младшем возрасте. У всех них было общий фенотип лица: глаза, нос и губы были похожи. Два ребенка были родственниками — сестрами. Секвенирование генома показало, что у первого и второго ребенка присутствовали сложные гетерозиготные варианты гена ATG4D, которые дети наследовали по аутосомно-рецессивному типу. У третьего ребенка ученые наблюдали такие же варианты гена, как и у ее старшей сестры — второго ребенка в исследовании. Обнаруженные варианты гена включали три точечные мутации, которые должны были приводить к сдвигу рамки считывания или к миссенс-мутациям. Однако анализ клеточных линий, полученных от пациентов, показал, что эти мутации не влияют на экспрессию мРНК и последующую трансляцию фермента ATG4D.  Ученые по очереди в разных комбинациях снижали экспрессию того или иного гомолога ATG4. Выяснилось, что в фибробластах и лимфобластах с двухаллельными вариантами ATG4D образование аутофагосом никак не нарушено, равно как не нарушена индукция аутофагии и вывод продуктов распада из клетки. Ученые обнаружили лишь незначительное снижение числа аутофагосом. Также исследователи проверили эффект нокдауна гена ATG4D в бессмертных клетках HeLa. В такой модели они зафиксировали значительное снижение экспрессии мРНК ATG4D и уровень фермента ATG4D. Кроме того, значительно снизилось количество аутофагосом, они стали меньше, при этом индукция аутофагии не пострадала. Однако несколько анализов in vitro показали, что варианты ATG4D, которые экспрессируются у больных детей, недостаточно эффективно запускают экспрессию вспомогательных генов. По мнению ученых именно дефект гена ATG4D стоит считать причиной наблюдавшегося у трех детей синдрома нарушения нервно-психического развития. Но пока неясно, как формируется специфический фенотип лица при такой мутации.