Несмотря на то, что мы умеем лечить туберкулез, от него умирает полтора миллиона человек каждый год. Чтобы помочь врачам в поиске действенных антибиотиков, ученые из консорциума The CRyPTIC получили 15211 изолятов микобактерии Mycobacterium tuberculosis из 23 трех стран. Из-за сложностей культивирования из первого наиболее полного набора изолятов пришлось удалить более 2000 образцов. Для итоговой выборки из 12289 изолятов получили сведения об их геноме с помощью полногеномного секвенирования нового поколения. После этого ученые проанализировали их лекарственную устойчивость к 13 антибиотикам первого (рифампицин, изониазид и этамбутол) и второго ряда (амикацин, канамицин, рифабутин, левофлоксацин, моксифлоксацин, этионамид, бедаквилин, клофазимин, деламанид и линезолид). Для изониазида и рифампицина ученые показали самый высокий процент невосприимчивых штаммов. Из препаратов второго ряда у левофлоксацина была самая высокая доля резистентных изолятов, а самая низкая — у бедаквилина. 6814 образцов были устойчивы как минимум к 1 препарату, а среди них у 4685 изолятов обнаружилась множественная лекарственная устойчивость.