Рак полости рта является девятым по смертности от рака во всем мире. При этом на ранних стадиях развития врач может его и не заметить, потому что диагностируют его по визуальному осмотру. Чтобы упростить диагностику, исследователи разработали тест для определения плоскоклеточной карциномы полости рта и плоскоклеточного рака ротоглотки, основанный на анализе микробиома. Человек может самостоятельно дома собрать образцы слюны и затем отправить их на проверку. Диагноз ставит модель, которую обучили на генетических данных из 945 образцов, 80 из них были взяты у людей с раком полости рта и 12 — у людей с раком горла. Было выявлено 88 различных изменений в экспрессии генов у людей с раком, а также определены 182 генетические особенности, уникальные для бактерий, содержащихся в образцах этих людей (110 видов и 72 кластера микробных генов). Затем модель проверили на независимой группе из оставшихся 230 образцов от людей, 134 из которых не имели рака или имели предраковое заболевание полости рта. Тест правильно классифицировал пациентов с положительным результатом на плоскоклеточную карциному полости рта на ранней и поздней стадии в 90 процентов случаев, пациентов с положительным результатом на плоскоклеточную карциному ротоглотки в 84,2 процентах случаев и 94 процента участников без рака. Это означает очень низкий уровень ложноотрицательных или ложноположительных результатов.