AI в поисках антибиотика Устойчивость бактерий к антибиотикам резко возрастает во всем мире, исследователи прогнозируют, что если срочно не разработать новые лекарства, то к 2050 году устойчивые инфекции могут убивать десять миллионов человек в год. Однако за последние несколько десятилетий процесс открытия и утверждения новых антибиотиков замедлился. Причин этому может быть несколько, одна из которых - несовершенство бизнес-модели. Исследователи из Массачусетского Института Технологий (MIT) обучили нейронную сеть находить молекулы, подавляющие рост бактерии Escherichia coli, используя коллекцию из 2 335 молекул, для которых была известна антибактериальная активность. Сюда входит библиотека из примерно 300 одобренных антибиотиков, а также 800 натуральных продуктов из растительных, животных и микробных источников. Алгоритм учится предсказывать молекулярную функцию без каких-либо предположений о том, как работают лекарства, и без обозначения химических групп. После того, как нейронная сеть была обучена, исследователи использовали ее для проверки библиотеки под названием Drug Repurposing Hub, которая содержит около 6 000 молекул, исследуемых для лечения заболеваний человека. Задачей было предсказать, какие из них будут эффективны против кишечной палочки (E. coli), и показать им только те молекулы, которые отличаются от обычных антибиотиков. Из полученных результатов отобрали около 100 кандидатов для физического тестирования. Один из них - молекула, изучаемая в качестве средства для лечения диабета, - оказалась мощным антибиотиком, который они назвали галицином в честь HAL, интеллектуального компьютера из фильма "2001 год: Космическая Одиссея". В испытаниях на мышах эта молекула была активна против широкого спектра патогенов, включая штамм Clostridioides difficile и один из видов Acinetobacter baumannii, который является "панрезистентным" и против которого срочно требуются новые антибиотики. В отличие от большинства антибиотиков, галицин воздействует на на ферменты участвующие в биосинтезе клеточной стенки, а нарушает поток протонов через клеточную мембрану. Антибиотикорезистентные бактерии, это апокалиптичненько. https://bit.ly/3rUuKGK #disease #tech