Я уже ушел, но многим на НГ может быть полезно это объявление от моего соратника по трансгуманизму Миши Батина.
Советую всем разработчикам и инженерам, кто хочет прокачаться в сфере анализа данных для борьбы со старением.
Минимально требуемые навыки — базовые знания Python и R. Плюс желание заниматься сферой longevity.
Дальше цитата:
Каждую среду, начиная с 4 января, будет проходить Школа анализа данных Проекта AGCT.
Мы прочтем бесплатный курс лекций по темам:
1. Определение геномной сети. Понятие регуляторов: энхансер, сайленсер, транскрипционный фактор. Примеры регуляции и мотивов: цинковый палец, лейциновая застежка (кратко). Подсети метаболической сети.
2. RNA-seq, WGS и экзомы. Основы секвенирования. Понятие экспрессии гена, численное выражение экспрессии (как определяется), FPKM, TPKM. Дифференциальная экспрессия, аннотация генома и транскриптома.
3. Метиллирование и метилом, генные часы, хроматин и его роль. Примеры, mTOR или воспалительный процесс.
4. Мат. основы анализа графов. Определение графа, обхода графа, комьюнити на графе. Мотивы на графах (scale-free графы, случайные графы). Отличие метаболической сети от всех остальных с т.зр. топологии
5. Алгоритмы-1. Поиск коммьюнити на графе. Алгоритмы кластеризации узлов графа (без ML).
6. Алгоритмы-2. Вычисление насыщения (enrichment), статистические критерии, GSEA, enrichR.
7. Базы данных. KEGG, GO, WikiPathway
8. Алгоритмы-3. Новые методы построения сетей: GENIE3, pathfindR, GRNBoost2. ML-подход к кластеризации и аннотации
9. Канцерогенез. Отличия раковых клеток от здоровых, гликолиз, механизм апоптоза, восстановление теломеров. Метаболическая сеть апоптоза и её возможные повреждения, как пример.
10. Старение и его проявление в метаболизме. Возможные примеры воздействия различных гипотез клеточного старения на метаболическую сеть.
11. Бизнес-аналитика биотех-проектов в области анализа данных. Перспективные направления, возможности и подводные камни.
Можно записываться и всё обсуждать в чате Проекта AGCT
https://t.me/+-GZtdAqsOvcyMGVi