Candida auris вызывает т. н. инвазивный кандидоз, при котором инфицируется кровоток, центральная нервная система и внутренние органы. Жертвами C. auris становятся люди с ослабленным иммунитетом, страдающие серьезными хроническими заболеваниями. В 60-70% случаев терапия не дает результата: затруднена диагностика (по строению грибок схож с другими видами Candida), и пациент получает неправильное лечение; грибок демонстрирует устойчивость к антибиотикам. Относится к внутрибольничным инфекциям (ВБИ), случаев выявления вне медицинских учреждений почти не зафиксировано.