Закончилось очередное медицинское соревнование по оценке стадии рака простаты по снимкам биопсии(ткани) с микроскопа - "Prostate cANcer graDe Assessment (PANDA) Challenge".
Необходимо было оценить кусочки ткани, полученные путем биопсии простаты. Биопсия выполняется специальной иглой, "вырезающей" кусочек простаты цилиндрической формы. Обычно берется 12 таких порций и каждый оценивается отдельно. Дальше гистолог нарезает эти кусочки на плоские порции, которые фиксируются на предметное стекло.
Основной особенностью соревнования был формат изображений. Каждое исследование представлялось в виде tiff файла, который содержал в себе три одинаковых по содержанию, но разных по разрешеню снимков. Более того, исследуемая ткань не занимала даже половины изображения, что сделало соревнование не просто гонкой за лучшие модели, но и за правильную предобработку данных.
Отдельно может кому-то запомниться "прекрасная" разметка, где трейн размечали студенты, а тест был размечен не всегда согласными экспертами. Паблик считался на 42%, тем не менее произошел неслабый шейкап. Так Ян Пан с 1 места улетел на 37, а многие люди с первой 20 остались без медалей вовсе.
Для Казахстанского сообщества DS/ML соревование выдалось бронзовым.