Ответ кроется в первом каноническом правиле Василия Великого:

— Еретиками называют "совершенно отторгшихся, и в самой вере отчуждившихся

— Раскольниками: разделившихся в мнениях о некоторых предметах церковных, и о вопросах, допускающих уврачевание;

— Самочинными сборищами: собрания, составляемыя непокорными пресвитерами, или епископами, и ненаученным народом"

В качестве примера еретиков Василий приводит маркионитов, валентиан и других гностиков, отвергающих крещение во имя Отца, Сына и Святого Духа и / или Ветхий завет. Ариан в списке нет, потому что они, признавая классическую крещальную формулу, расходятся с ортодоксами в ее трактовке, что делает их раскольниками в глазах Василия Великого. Перекрещивать крещеных у ариан, по его мнению не следует.

К слову говоря, сам Василий Великий был крещен и рукоположен в официальной, антиникейской (отрицающей решения первого Вселенского собора) церкви, и долгие годы сослужил своему епископу арианину (ок, полуарианину). И да, апостольское правило о запрете молитв с еретиками в годы его написания никто и не думал применять к молитвам с арианами.

Внимательное изучение ранней церковной истории все же очень увлекательная вещь, позволяющая несколько иначе взглянуть на сегодняшние церковные споры и разделения