Агентство IARPA, подразделение разведки США, запустило в 2018 г. программу FELIX. Название, конечно же, аббревиатура: Finding Engineering-Linked Indicators, где Х символизирует хромосому. Цель программы — уметь распознавать следы инженерии в биообъектах, т.е. обнаруживать вмешательство в геном, если оно было.
Как показали баталии вокруг происхождения SARS-CoV-2, интерпретировать генетические данные можно по-разному. Это вообще нетривиальная научная задача — как различать природное и созданное людьми.
Герберт Саймон еще в 1968 году предложил выделить «Науки об искусственном», подразумевая различие, и был бы сильно удивлен сегодня. В XX веке поиск искусственности касался разве что программы SETI, но теперь инженерная биология уже размывает границы природы, а затем сотрет их полностью.
Будь Саймон жив, я бы показал ему статью Ten future challenges for synthetic biology. Она небольшая, но картину будущего дает. Живое будут модифицировать, комбинировать или создавать de novo, под функции. Две идеи отмечу особо: выращивание живых материалов и дизайн биосистем с учетом их последующей эволюции, это обещает переворот в проектировании.
Плюс не раз упомянутая мной статья Бонгарда/Левина, как еще более глубокое развитие темы.
По модификации ДНК с помощью машинного обучения уже могут отследить лабораторию, где эту модификацию провели. Но если сегодня ломают голову над куском генома, вставлен ли он, то в будущем любой геном окажется под подозрением: инженерные микробы, растения и животные будут так же распространены как домашний скот в наши дни, а «природную» ДНК легко смогут синтезировать.
Каждую весну я захожу на сайт iGEM, ежегодного международного состязания по инженерной биологии, и смотрю распределение команд по странам. Это хороший индикатор, кто и как готовится к будущему. На момент этой публикации подано 370 заявок. По понятным причинам в этот раз ни одной от России; от Британии их 9, от Франции — 10, от Германии — 14, от США — 59, внушительно.
Китай везет на iGEM 145 команд и наращивает их количество каждый год. Ранее, параллельно с FELIX, Пентагон запустил программу Safe Genes от DARPA для противодействия технологиям редактирования ДНК (поиск anti-CRISPR). Игра на этом поле предстоит долгая, упорная, ставки будут высоки.
New biotechnologies have enabled the development of diverse biological systems, with potential benefits ranging from new vaccines to improved crops. Genome editing tools have made biological engineeri...