Genomics in the Cloud: Using Docker, GATK, and WDL in Terra Авторы: Geraldine A. Van der Auwera, Brian D. O'Connor (2021) Данные в области геномики стремительно растут в количестве и качестве. Всего через несколько лет такие организации, как Национальный институт здоровья, будут размещать более 50 петабайт - или более 50 миллионов гигабайт - геномных данных, и они обращаются к облачной инфраструктуре, чтобы сделать эти данные доступными для исследовательского сообщества. Из этой практической книги исследователи узнают, как работать с алгоритмами геномики, используя инструменты с открытым исходным кодом, включая Genome Analysis Toolkit (GATK), Docker, WDL и Terra. Эта книга охватывает: ✔️Основы геномики и вычислительной техники; ✔️Основные операции облачных вычислений; ✔️Начало работы с GATK, плюс три основных конвейера; ✔️Автоматизация анализа с помощью скриптов рабочих процессов с использованием WDL и Cromwell; ✔️Масштабирование выполнения рабочего процесса в облаке, включая распараллеливание и оптимизацию затрат; ✔️Интерактивный анализ в облаке с использованием блокнотов Jupyter. Скачать книгу 👉 @bfbook