В рубрике как это работает у них, небольшой обзор проектов по работе с данными в биоинформатике. Небольшой потому что сама эта тема огромна, а публикуемые данные значительно превосходят любой портал открытых государственных данных. Я сделаю акцент не на обработки больших наборов данных, а на проектах по повышению понимания данных и их систематизации. Bioschemas Многие знают про существование Schema.org как совместной инициативы поисковиков Google, Microsoft, Yahoo и Yandex для создания реестра для разметки именованных объектов. Bioschemas [1] - это расширение Schema.org объектами относящимся к химическим веществам, генам, таксонам, молекулам и другим данным важным для исследователей. Создание проекта финансируется Евросоюзом в рамках программы ELIXIR [2]. Проект идет уже более 5 лет [3] и его основная цель в том чтобы метаданные в каталогах и репозиториях данных связанных с науками о жизни были бы стандартизированы и удобны для работы. Data Discovery Engine Помимо структурированного описания объектов и понятий в каталогах данных важна ещё и возможность поиска по этому структурированному описанию. Data Discovery Engine [4] - это проект с руководствами по описанию метаданных и по их сбору из существующих каталогов данных таких как CD2H, N3C, Outbreak.info и NIAID Data Portal. Сейчас там агрегируются наборы данных (Datasets) и программные инструменты (Computational Tools), а в основе профили объектов определённые в Schema.org FAIRSharing Помимо Bioschemas в мире существуют сотни других стандартов публикации метаданных, как в науках о жизни, так и в других науках. FAIRSharing [5] - это один из крупнейших в мире каталогов таких стандартов в реестре которого собраны руководства, схемы, описания идентификаторов, рекомендации и тд. для данных публикуемых исследователями. — Ссылки: [1] https://bioschemas.org [2] www.elixir-europe.org/about-u…celerate [3] docs.google.com/documen…2x0/edit [4] https://discovery.biothings.io/ [5] https://fairsharing.org #opendata #openscience #openaccess #standards #data