Взвешенный корреляционный сетевой анализ Взвешенный корреляционный анализ сети (WGCNA) является широко используемыми методами для изучения биологических сетей на основе парных корреляций между переменным. Это позволяет определять кластеры, внутри модульные концентраторы и сетевые узлы с учетом членства в кластерах, изучать отношения между модулями совместного выражения и сравнивать топологию сети различных сетей. WGCNA может использоваться как метод сокращения данных (связанный с косвенным факторным анализом), как метод кластеризации (нечеткая кластеризация), как метод выбора признаков (например, как метод скрининга генов). Анализ происходит в 3 этапа. Сначала определяется мера сходства элементов сети. Затем строится матрица смежности используется для количественной оценки того, насколько сильно узлы связаны друг с другом. Заключительным этапом является кластеризация сетевых модулей с использованием меры сетевой близости. Программный пакет WGCNA в R предоставляет функции для выполнения всех аспектов взвешенного сетевого анализа (построение модуля, выбор гена-концентратора, статистика сохранения модулей, дифференциальный сетевой анализ, сетевая статистика).  #что_есть_что_в_sna