Формирующее влияние на культ Ваджрайогини оказал недвойственный шиваизм. Новаторские исследования в этой области, проведенные Сандерсоном (1993, 1994b, 1995, 2001b), показали, что высшие буддийские тантры поразительно зависят от недвойственных шиваитских источников; настолько, что это составляет не что иное, как то, что он называет «благочестивым плагиатом» (1995). Сандерсон (2001b) подсчитал, что в коренном тексте традиции Чакрасамвары, Лагхусамвара-тантре, «длинные отрывки, насчитывающие около двухсот стихов, то есть почти треть всего текста, были отредактированы из шиваитских оригиналов», которые: поскольку эта часть шиваитского канона сама по себе сохранилась лишь частично, указывают на внушительное заимствование. Культы шиваитов, которые сильнее всего оставляют свой отпечаток на высших и наивысших буддийских тантрах, принадлежат мантрапитхе, или «престолу мантр», и видьяпитхе, или «престолу видьи», оба из которых являются подразделениями в этом потоке шиваитского устройства, и называется мантрамаргой, или «путем мантр» (Sanderson 1988). Поклонение внутри мантрапитхи относилось к типу Шивы, называемого «бхайрава» («ужасающий»), гневной, кремационной форме бога в союзе со столь же ужасающей супругой, такой как Сваччандабхайрава (или Агхора) с его супругой Агхорешвари. Элементы места кремации еще более очевидны в Видьяпитхе, где они главным образом связаны с эзотерическими культами, основанными на женской силе (шакти), такими как трика и крама. Трика фокусируется на трех богинях, Пара, Апара и Парапара, у которых есть подчиненные супруги в формах бхайравы и свита мужских и женских божеств. Культы Крама проявляют гневные формы богини Кали. В одной из высших форм недвойственного шиваизма богине поклоняются в мандале из двенадцати идентичных Кали; она действительно появляется одна, без супруга, топчет труп Бхайравы или носит части его расчлененного тела в качестве украшений. буддийские йогинитантры считали себя родственными йоготтаратантрам, но превосходящими их. Йогини-тантры больше всего опирались на традицию Видьяпитхи. Elizabeth English «Vajrayogini: Her Visualization, Rituals, and Forms.»