Создана платформа для сравнения вычислительных моделей в области 3D-геномики
Томские и новосибирские исследователи разработали веб-платформу, которая позволяет сравнить эффективность существующих предсказательных моделей для 3D-укладки ДНК. Работа выполнена научной группой Института цитологии и генетики Сибирского отделения РАН и Научно-исследовательского института медицинской генетики Томского национального исследовательского медицинского центра РАН.«За последние десять лет появилось много работ, которые говорят о том, что укладка ДНК в ядре клетки неслучайна и имеет важное значение для работы генов. То есть, нарушая не сами гены, а их расположение в ядре, можно вызвать самые разные негативные последствия, к примеру, в виде наследственных заболеваний», – рассказывает ведущий научный сотрудник Института цитологии и генетики СО РАН, кандидат биологических наук Вениамин Фишман.Существует множество разнообразных механизмов, которые определяют укладку ДНК в ядре клетки, но изучены они не до конца. Параллельно несколько научных групп в мире сделали около десятка вычислительных моделей, которые на основе тех или иных параметров генома позволяют предсказать, как именно будет уложена ДНК...
ЧИТАТЬ ПОЛНУЮ ВЕРСИЮ